Для аппарата «Марина» принята двухкорпусная архитектура, так как она обеспечивает наибольший запас плавучести и обтекаемые эстетичные обводы. Наибольший запас плавучести целесообразен для безопасной эксплуатации подводного аппарата при любых комбинациях разгерметизации прочных конструкций, а также для уменьшения осадки, что необходимо для получения высокой скорости его буксировки.

Малое водоизмещение подводного аппарата наложило дополнительные условия на выбор элементов при его проектировании. Разработка систем и конструкций аппарата велась таким образом, чтобы облегчить их обслуживание, а также обеспечить их повышенную надежность и безопасность при эксплуатации. Подводный аппарат может быть легко адаптирован для выполнения научно- исследовательских задач на морском и океаническом шельфе, а также для выполнения подводно-технических работ в промышленных целях.